SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit酶试剂盒Takara Clontech

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SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
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Clontech R400748 SMART-Seq® HT PLUS Kit 48 Rxns ¥26,309 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech R400749 SMART-Seq® HT PLUS Kit 96 Rxns ¥51,365 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech R400744 Unique Dual Index Kit – 48U 48 Rxns 询价 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech R400745 Unique Dual Index Kit – 96U 96 Rxns 询价 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634455 SMART-Seq® HT Kit 12 Rxns ¥4,458 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634456 SMART-Seq® HT Kit 48 Rxns ¥16,049 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634436 SMART-Seq® HT Kit 480 Rxns ¥118,883 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634437 SMART-Seq® HT Kit 96 Rxns ¥30,910 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634438 SMART-Seq® HT Kit 192 Rxns ¥57,064 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634439 SMART-Seq® HT Lysis Components 96 Rxns ¥1,199 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
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SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 延伸     SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
         
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
 
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT Plus Kit:自动化友好型的单细胞mRNA全长分析
· 自动化友好型 - 兼容自动化工作站,更少的时间分析更多的样本
· 高灵敏度 - 可以从单细胞或10 pg总RNA起始(起始量:1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA)
· 高质量的RNA-Seq数据 - 保留全长基因信息,低rRNA比率,高基因检出数,有效扩增GC-rich转录本
· 单管操作流程 - SMART-Seq HT PLUS Kit包含完整的cDNA合成和文库构建流程,分别在单管中进行,减少样品损失与混淆,降低手动操作误差
· 增强的测序性能 - SMART-Seq HT PLUS Kit整合双端特殊index(UDI),即便多个文库pool后用高通量型illumina测序仪(如Novaseq)分析,也能得到正确结果
· 更高的文库产量 - 更便于使用高通量型illumina测序仪测序(如Novaseq),或保存剩余的文库用于多次测序
 
产品说明
SMART-Seq HT Kit(SS-HT)和SMART-Seq HT Plus Kit(SS-HT PLUS)均兼容自动化移液工作站,采用oligo(dT)引物,支持1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA起始。
SS-HT试剂盒是从第4代的SMARTer Ultra Low试剂(SMART-Seq v4)发展而来的,具有简化的操作流程,将原有的反转录和PCR扩增步骤整合为一步,且不影响性能。细胞分离或RNA提取后,仅通过一步RT-PCR扩增双链cDNA,然后进行纯化完成操作。cDNA合成可在4小时内完成,整个文库构建方案可在2天内完成。而且,SMART-Seq HT试剂盒具有与SMART-Seq v4试剂盒相同的灵敏度和可重复性。核心的SMART技术,是一种对全转录组研究,以及包括细胞内剪接位点,可变剪接研究的非常强大的工具,且可以检测全长基因。 Oligo(dT)可以从高品质总RNA(RIN> 8)或完整细胞中特异性扩增mRNA。 通过采用LNA技术,提升了模板转换的效率与基因检出数等性能。
SS-HT PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上,同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727
,10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823及单次使用的双端特殊index(UDI),提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶,以实现对合成cDNA的片段化,接着利用特别的茎环形接头构建高品质illumina文库。在建库阶段,单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库!
 
SS-HT Kit:流程缩短、性能不变!
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
图1 SMART-Seq HT的技术流程
 
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
图2 SMART-Seq v4和SMART-Seq HT工作流程的比较
 
SMART-Seq HT(右)是由SMART-Seq v4方法(左)经过改进而来的一个手动操作时间更短的高通量工作流程。使用FACS方法获得单细胞,SMART-Seq HT试剂盒只需3个操作步骤即可制备cDNA,而SMART-Seq v4试剂盒需要6步。SMART-Seq HT工作流程的一个重要步骤是一步RT-PCR,即使用一步RT-PCR缓冲液,进行高效的反转录和PCR扩增cDNA的过程。
 
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
图3 使用SMART-seq v4 kit和SMART-Seq HT kit从FACS分选的293T细胞中获得的高重复性的基因表达数据
 
使用SMART-Seq v4试剂盒(SSv4_1-SSv4_12)和SMART-Seq HT试剂盒( HT_1-HT_9)(上图)从21个293T细胞单细胞制备文库,并对每个细胞获得的基因表达性进行评估。层次聚类热图展示了所有细胞之间的Euclidean distances,并显示从0.74到0.97的Pearson相关性。不仅用相同试剂盒制备的细胞之间可以观察到非常高的相关性,而在两种试剂盒之间的相关性也非常高。这些数据表明,SMART-Seq HT的工作流程与SMART-Seq v4相比,在基因表达分析中没有显著的偏差。
 
SS-HT PLUS Kit:不只是一个Kit,更是完整的单细胞RNA-Seq建库体验!
为了使单细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位,我们全新推出了SS-HT PLUS Kit。
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发,构建更高品质illumina文库
 
Takara科学家从10 pg小鼠脑total RNA起始,采用SMART-Seq HT Kit完成cDNA合成。随后分别使用SS-HT Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库,并比较性能差异。
 
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
(比较数据来源于Takara Bio USA, Inc.)
 
从测试数据中可以看出,SS-HT PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍,而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪,如Novaseq。
 
两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序,并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。SS-HT PLUS文库能比A公司文库多检出10%的基因,从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息!
 
 
产品详情请点击:SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
更多实验数据:
SS-HT Kit
SS-HT Plus Kit
 
延伸阅读:
单细胞NGS解决方案
 
 

页面更新:2022-09-02 10:46:54

SMART-Seq Stranded Kit酶试剂盒Takara Clontech

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SMART-Seq Stranded Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 634442 SMART-Seq® Stranded Kit 12 Rxns ¥12,631 SMART-Seq Stranded Kit SMART-Seq Stranded Kit SMART-Seq Stranded Kit
Clontech 634443 SMART-Seq® Stranded Kit 48 Rxns ¥41,939 SMART-Seq Stranded Kit SMART-Seq Stranded Kit SMART-Seq Stranded Kit
Clontech 634444 SMART-Seq® Stranded Kit 96 Rxns ¥55,549 SMART-Seq Stranded Kit SMART-Seq Stranded Kit SMART-Seq Stranded Kit
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SMART-Seq® Stranded Kit
SMART-Seq® Stranded Kit:以单细胞起始,构建高质量的链特异性RNA-seq文库
· 操作简便:以1–1,000个细胞 或10 pg-10 ng的总RNA起始,仅需7h即可完成文库制备;
· 高灵敏度:可以单细胞起始,保留链特异性,最终获得全长总RNA序列信息;
· 高再现性:准确检测包含编码和非编码RNA在内的全部转录组;
· 用途广泛:适用于降解的样本;
· 适用对象:人、小鼠、大鼠。
 
SMART-Seq® Stranded Kit能够直接从1-1,000个完整细胞(或10 pg-10 ng总RNA)起始,制备链特异性Illumina测序文库。本试剂采用随机引物法可以制备完整的转录组文库,并适用于部分降解及低品质的RNA。此外,本试剂采用专有的ZapR技术,在文库制备过程中去除核糖体cDNA。
 
如果是以oligo-dT引物起始对微量高品质的RNA进行cDNA合成时,推荐使用 SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing 或SMART-Seq HT Kit试剂盒。
 
SMART-Seq Stranded Kit
图1. SMART-Seq Stranded Kit的技术流程
 
SMART-Seq Stranded Kit
图2. 使用SMART-Seq Stranded Kit制备文库的结构特征
 
接头序列包含:通过PCR 1反应添加的可以与Illumina流动池结合生成簇的P7、P5序列(P7以淡蓝色表示,P5以红色表示),用于区分单个lane上多个样本的Index序列(Index 1 [i 7] 序列连接在P7端,Index 2 [i 5]连接在P5端)。并且还包括识别测序引物区域的Read 2(紫色)和 Read 1(绿色)。通过Read 1起始得到的原始RNA的反义链序列,Read 2起始获得的是原始RNA的正义链序列。其中,通过Read 2起始时,前3个碱基(XXX)是SMART-Seq Stranded Adapter衍生的序列。因此在双端测序时,需要在mapping前去掉这3个碱基。
 
SMART-Seq Stranded Kit
表1.不同样本起始量的分析结果
 
以人脑总RNA 10 pg至10 ng不同量起始,使用SMART-Seq Stranded Kit制备RNA-Seq文库。该表中所显示的数据是三次重复的平均值,且重复之间相关性系数非常高(Pearson/Spearman表示)。即使起始量为10 pg时,也具有非常高的重现性。
 
SMART-Seq Stranded Kit
图3. 在低起始量时,SMART-Seq Stranded Kit和Pico v2的比较
 
Panel A.以人脑总RNA (50 pg-10 ng)起始,分别使用SMART- Seq Stranded Kit和SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 -Pico Input Mammalian (Pico v2)制备RNA-Seq文库(均做三次重复)。从测序数据随机抽取250万paired-end reads进行生物学信息分析。
 
Panel B.比较这两个试剂盒在总RNA以 50 pg起始制备文库的转录表达水平 (见Panel A), SMART-Seq Stranded Kit (Pearson =0.97)的再现性高于Pico v2 (pearson =0.92)。
 
SMART-Seq Stranded Kit
 
SMART-Seq Stranded Kit
图4. 不同起始量样本的高重现性
 
利用FACS分离出A375细胞,分别以1-1,000个细胞起始使用SMART-Seq Stranded Kit制备测序文库。其中,以5-1,000个细胞起始时,均做两个重复;以单个细胞起始时,做12个重复。为了作比较,同时使用从两种1,000个细胞中纯化的总RNA制备文库。
 
Panel A.:1-1,000个细胞起始的分析结果;
 
Panel B.:通过聚类热图展示了Panel A.中所示的所有样本的Euclidea距离,以及Pearson相关系数(范围为0.85至0.99)。其中单细胞样本标记为Cell1-Cell12,其他样本分别标记为a-b。
 
TechnoteSMART-Seq Stranded Kit
 
产品详情请点击:SMART-Seq Stranded Kit
 
 

页面更新:2020-04-10 11:06:07

LongAmp® 热启动 Taq DNA 聚合酶–NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – DNA聚合酶与扩增技术 – 特殊PCR

LongAmp® 热启动 Taq DNA 聚合酶                              收藏

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LongAmp Taq 聚合酶信息

LongAmp® 热启动 Taq DNA 聚合酶--NEB酶试剂 New England Biolabs

概述

LongAmp Taq DNA 聚合酶是 Taq 和 Deep Vent DNA 聚合酶的优化混合,相比单用 Taq DNA 聚合酶,它能以更高的保真度扩增出更长的 PCR 产物。

LongAmp 热启动 Taq DNA 聚合酶

LongAmp 热启动 Taq DNA 聚合酶利用了一种特定合成的核酸适配体,它能够与酶可逆结合,当温度低于 45℃时抑制聚合酶活性,正常的热循环条件下释放聚合酶。

其它剂型

为了加样方便,LongAmp Taq 与 Long Amp 热启动 Taq DNA 聚合酶均有预混液剂型可供选择。LongAmp Taq PCR 试剂盒包含 LongAmp Taq DNA 聚合酶(2,500 units/ml)、dNTP 混合液(10 mM)、LongAmp Taq 反应缓冲液套装(5X)、MgSO4(100 mM)和无核酸酶污染的水。

浓度

2,500 units/ml。

参考文献

有关该产品特性和应用的参考文献请登陆 www.neb-china.com,www.neb.com。

LongAmp® 热启动 Taq DNA 聚合酶--NEB酶试剂 New England Biolabs