5-FAM [5-Carboxyfluorescein] Single isomer 货号：103-AAT Bioquest荧光染料

发表于2023年12月13日由Amresco中国

上海金畔生物科技有限公司代理AAT Bioquest荧光染料全线产品，欢迎访问AAT Bioquest荧光染料官网了解更多信息。

产品名称：5-FAM [5-Carboxyfluorescein] Single isomer
产品货号：103
产品品牌：AAT Bioquest

简单介绍

5-FAM是一个纯化的单一羧基异构体。它是*普遍的用来标记肽，蛋白质及核酸的绿色荧光试剂之一。它主要用来显影氩激光器488nm处被激发的一系列绿色荧光肽。同时也可用于配制各种小荧光分子。

产品描述

5-FAM 5-羧基荧光素 CAS 76823-03-5

5-FAM [5-Carboxyfluorescein] Single isomer 货号：103

货号	103	存储条件	f/l
规格	100 mg	价格
Ex (nm)	492	Em (nm)	516
分子量	376.32	溶剂	DMSO
产品详细介绍

产品基本信息

货号：103

产品名称：5-FAM [5-羧基荧光素]

规格：100mg

储存条件：-15℃避光防潮

保质期：24个月

产品物理化学光谱特性

分子量：376.32

外观：橙色固体

溶剂：DMSO

激发波长（nm）：492

发射波长（nm）：518

产品介绍

5-FAM 5-羧基荧光素是美国AAT Bioquest生产的荧光素，5-FAM是羧基荧光素的纯化单一异构体。它是用于标记肽，蛋白质和核苷酸的*流行的绿色荧光试剂之一。它主要用于开发各种绿色荧光肽，可以用488nm的Ar激光线激发。它还被用于制备各种小荧光分子。金畔生物是AAT Bioquest的中国代理商，为您提供*上等的5-FAM 5-羧基荧光素。

PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3酶试剂盒Takara Clontech

发表于2023年11月1日由Amresco中国

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	R300718	PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3	24 Rxns	￥5,518
Clontech	R300722	PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3	96 Rxns	￥19,606
Clontech	R300723	PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3	480 Rxns	￥83,328

收藏产品加入购物车

PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3

· 单细胞（或＜15 pg DNA）起始，可获得可重复的结果
· 卓越的等位基因再现性
· 易于使用和自动化
· 应用广泛，可以用于微阵列，PCR等

PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 (PicoPLEX WGA v3)可以从单细胞扩增DNA，获得高度可重复的文库。细胞裂解和预扩增后，进行低背景的PCR扩增，并在3小时内获得微克级产物。
除了延续之前PicoPLEX WGA Kit可进行高度可重复的拷贝数变异（CNV）分析外，该试剂盒通过使用高保真酶，尽可能减少扩增误差，并能检测单核苷酸变异（SNV）。

图1. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3技术

表1 .使用PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3进行高质量单核苷酸变异（SNV）检测

以单细胞 (1cell) 和5个细胞 (5 cells) 的GM12878细胞系 (Coriell研究所) 起始 (一式两份)，分别使用PicoPLEX WGA v3,A公司试剂盒和B公司试剂盒，以及bulk gDNA对照制备全基因组扩增产物，进行SNV检测的比较。其中B公司试剂盒虽然制备了足够的扩增产物，但只有5 cells样本中一个包含足够的扩增子进行测序，而其他样本无可用数据进行测序。根据Genome In a Bottle (GIB) 和hg19 (human Genome assembly GRCh37, Ensembl) 数据库的交叉分析，预计GM12879细胞系总共存在78个SNVs。由于扩增子的设计，2×75 bp的读取长度很短，78个SNVs中的4个未能检测到。因此，检测的SNV总数减少到74个。使用VarDict软件，以≥10reads (10X coverage) 和等位基因频率≥20％为基准从BAM文件分析SNV。与其他两个公司试剂盒相比，PicoPLEX WGA v3具有更高的call rates和更低的等位基因丢失率。

（数据来源于Takara Bio USA, Inc.）

图2. 基于PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的CNV检测

以来自不同细胞系(GM22601、GM05067和GM12878)的单细胞起始，使用PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3扩增基因组。之后取1ng的扩增产物，使用Illumina Nextera XT Kit制备文库，并在Illumina MiSeq（PE 75）进行测序。对Fastq文件去除接头序列信息后，与human genome assembly GRCh37进行比对。只分析常染色体。对于这两个panels，校准归一化至100万reads，使用bedtools 2.25.0计算每1 Mb的 bin的reads数。使用Integrative Genomics Viewer (IGV)绘制bin counts的log2 ratio (Sample/Reference)。PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3还显示了可以高品质的进行染色体异倍性分析。

图3. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的全基因组覆盖范围的重现性高

以GM12878的单细胞样本起始（一式两份），分别使用PicoPLEX WGA v3，A公司试剂盒和B公司试剂盒扩增基因组。之后取1ng的扩增产物，使用Illumina Nextera XT Kit制备文库，并在MiSeq（PE 75）进行测序。然后与human genome assembly GRCh37进行比对，归一化至1M reads (0.5M paired-end reads)后，使用bedtools 2.25.0计算每个1 Mb的bin的reads数。对这两个单细胞文库的每个窗口的total read进行绘制，计算Pearson和Spearman相关性并在每个图中标明。

Panel A. 包含异常值的样本。*由于不同技术存在不同的偏差，没有排除相关点，所以图表的比例不同。
Panel B. 排除异常值的样本。与A公司和B公司试剂盒相比，PicoPLEX WGA v3具有更高的重现性和覆盖度。

（数据来源于Takara Bio USA, Inc.）

Technote：

资料下载：

产品详情请点击：

页面更新：2020-09-01 09:47:03

高灵敏度的单细胞全长mRNA分析酶试剂盒Takara

发表于2023年10月22日由Amresco中国

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

高灵敏度的单细胞全长mRNA分析
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	634470	SMART-Seq Single Cell Kit	12 Rxns	￥13,341
Clontech	634471	SMART-Seq Single Cell Kit	48 Rxns	￥37,759
Clontech	634472	SMART-Seq Single Cell Kit	96 Rxns	￥65,697

收藏产品加入购物车

高灵敏度的单细胞全长mRNA分析
SMART-Seq Single Cell Kit

· 简便的工作流程-可以FACS或其他方法分选的单细胞起始
· 灵敏度高、一致性好-非常适用于单细胞（尤其是RNA含量非常低的细胞和细胞核）RNA-Seq的研究，可检测更多基因
· 可靠的全长cDNA制备Kit-优于许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如SMART-Seq2
· 高度灵活的工作流程-可与自动化设备兼容

SMART-Seq Single Cell Kit（SSsc）是一个具有高灵敏度和可再现的cDNA制备试剂盒，适用于单细胞和细胞核的RNA-Seq分析。该试剂盒可以从已知具有低RNA含量的单个细胞（例如，PBMC）直接生成高质量的全长cDNA。该试剂盒基于SMART-Seq技术进行优化改良，具有更高的灵敏度和再现性。远远超过许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如SMART-Seq2和Takara Bio现有试剂盒（SMART-Seq V4）。

图1. 与Smart-seq2法的比较

以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库，分别采用SMART-Seq Single Cell Kit（SSsc,18个重复）和Smart-seq2法（Smart-seq2，20个重复）合成cDNA（均进行19个PCR循环扩增），然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析（所有样本都均一化至1.75M paired-end reads）。

Panel A cDNA的制备方法不同，结果也不同。相比而言，Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高，而检测到基因鉴别的reads数相对较少。

Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。

图2. 与SMART-Seq v4的比较

Panel A 以淋巴母细胞系GM22601单细胞为样本制备文库，分别采用SMART-Seq Single Cell Kit（SSsc）和SMART-Seq v4（SSv4）合成cDNA（均用19个PCR循环扩增）。所有样本都均一化至1.25M paired-end reads。使用SSsc建库，能获得更高的文库产量。

Panel B 从一位健康供体收集到约50个PMBC单细胞，分别采用SSv4 和 SSsc制备cDNA，然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。不论测序深度如何，SMART-Seq Single Cell Kit检测的基因数均是SMART-Seq v4的1.6倍以上。

Technote：
点击图片查看

资料下载：

产品详情请点击：

页面更新：2020-05-19 13:30:55

Amresco官网

Amresco中国VWR中国

标签归档：single

5-FAM [5-Carboxyfluorescein] Single isomer 货号：103-AAT Bioquest荧光染料

5-FAM是一个纯化的单一羧基异构体。它是*普遍的用来标记肽，蛋白质及核酸的绿色荧光试剂之一。它主要用来显影氩激光器488nm处被激发的一系列绿色荧光肽。同时也可用于配制各种小荧光分子。

5-FAM 5-羧基荧光素 CAS 76823-03-5

PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3酶试剂盒Takara Clontech

高灵敏度的单细胞全长mRNA分析酶试剂盒Takara

2024年 5月
一	二	三	四	五	六	日
		1	2	3	4	5
6	7	8	9	10	11	12
13	14	15	16	17	18	19
20	21	22	23	24	25	26
27	28	29	30	31